أعلنت الحكومة اليمنيّة والمعترف بشرعيتها دولياً قطعها العلاقات مع قطر في 5 يونيو، نفس اليوم الذي قطعت فيه السعودية علاقتها بقط، وهذا مفهوم بحكم أنّها حكومة مقيمة في الرياض ومدعومة في شكل أساسيّ من المملكة العربيّة السعوديّة. كما رحّبت الحكومة اليمنيّة بإنهاء مشاركة قطر في التحالف، ومشاركة قطر في التحالف الذي تقوده السعودية لقتال الحوثي لم تكن سياسيّاً وعسكريّاً مهمّة أو فعّالة مثل الإمارات العربيّة المتّحدة والسعوديّة، باستثناء قوّة قطريّة صغيرة لا تتجاوز المئة جنديّ على الحدود اليمنيّة-السعوديّة.

أبرز ملامح الدعم القطريّ للحكومة الشرعيّة في اليمن هو تكفّلها بدفع رواتب موظّفي السلك الدبلوماسيّ اليمنيّ منذ عامين، إضافة إلى تغطيتها المنحازة لهذه الحكومة والتحالف في القنوات القطريّة مثل الجزيرة والعربي، وكذلك تمويل قطر لقنوات يمنيّة موالية للإخوان نسبيّاً مثل قناة يمن شباب، وكذلك قناة بلقيس المملوكة من الناشطة وعضو حزب الإصلاح الحاصلة على جائزة نوبل توكل كرمان ومقرّها تركيا. ويعد حزب الإصلاح أبرز القوى السياسية التي تعارض الحوثي والقريبة من رئيس الحكومة المقيمة بالرياض عبدربه منصور هادي. ولقد تعرض الحزب الذي يمثل حركة الإخوان المسلمين باليمن لقمع شديد من الحوثيين الذين اقتحموا منازل قياداتهم واعضاءهم واعتقلوا بعضهم، لأسباب سياسية ومذهبية، لذا فرت معظم قيادات الحزب وكوادره الرئيسين لخارج اليمن مع بداية الحرب باليمن.

حسمت الحكومة اليمنيّة أمرها سريعاً في أزمة الخليج الحاليّة، لكنّ التناقض ظهر في موقف حزب الإصلاح الإخوانيّ في اليمن الذي أصدر بياناً بذات اليوم 5 يونيو يؤيّد فيه موقف الحكومة الشرعيّة ضدّ قطر. كان ذلك على مستوى القيادة، حيث أنّ قيادات حزب الإصلاح الصفّ الأوّل تعيش في المملكة العربيّة السعوديّة مثل رئيس الحزب محمد اليدومي.

بينما تعيش بقيّة قياداته وكوادره في تركيا حيث تبثّ منها قناة بلقيس، لهذا كان هناك تباين بين موقف الحزب الرسميّ وموقف كوادره وشبابه الأكثر تحرّراً في تركيا والمتعاطف مع قطر. أصبح هذا التعاطف الإخوانيّ مع قطر امتداداً أيضاً للحملة التي تشنّها كوادر الحزب ضدّ الإمارات العربيّة المتّحدة، ودورها في اليمن، متحاشين في شكل كبير الهجوم على السعوديّة أو انتقادها.