شكلت الأنفاق أحد القضايا الإشكالية المهمة في توتر العلاقة بين حماس ومصر، بسبب الاتهامات التي توجه للحركة باستخدامها لتهريب المسلحين، وتوصيل السلاح بين غزة وسيناء.
ولذلك قرر الرئيس السيسي فور توليه حكم مصر في يونيو 2014، تنفيذ حملة عسكرية لهدم الأنفاق.