قد نشر الموقع الرسمي للسيستاني مقالة في الخامس والعشرون من جولاي تنقل من المرجع الشيعي الكبير مطالبته المسؤولين العراقيين بعدم التشبث بمناصبهم في إشارة إلى اصرار المالكي على ولاية ثالثة. كما أن الموقع نشر دعم مراجع الشيعة الآخرين في قم والنجف لموقف السيستاني. وقد جاء ذلك رداً على موقف السيد محمود الشاهرودي في دعم المالكي، وهو الرجل الدين البارز القريب من القيادة الايرانية وذو علاقة تاريخية من حزب الدعوة التي يرأسه المالكي.

قد سبق مراراً أن المتحدثون الرسميون للسيستاني ينتقدون مواقف الحكومة العراقية في مجالات عديدة وايضاً مواقف شخص رئيس الوزراء؛ ولكن هذه أول مرة أن يتم التصريح باسم المالكي مطالباً اياه بالانسحاب من الترشيح لرئاسة الوزراء. وقد تلى ذلك قيام السيد جعفر الصدر وهو نجل مؤسس حزب الدعوة باصدار دعوة للقياديين في هذا الحزب بالوقوف مع المرجعية وانسحاب دعمهم للمالكي معتبراً اياه المانع الرئيسي لحلّ الخلافات وتشكيل الحكومة الجديدة بسبب تعنته واصراره على البقاء في السلطة.

وفي نفس السياق، اعلنت كتلتا بدر والمستقلون المنضوين ضمن تحالف دولة القانون الذي يرأسه المالكي بأنهم سوف ينفصلون عن التحالف في حال اصرار المالكي على ترشيح نفسه. وهذا يعني أن دولة القانون ستفقد اغلبيتها داخل التحالف الوطني الذي يجب اختيار رئيس الوزراء منه.

وإثر هذه الأحداث، قام المالكي بارسال رسالة نصية تحذيرية الى مكتب السيستاني، وقد اطلع المونيتور عليها من مسؤول في المكتب. وقد جاء فيها: "لقد تقلينا بأمتعاض شديد اشاراتكم في خطبة صلاة الجمعة بكربلاء المقدسة عبر ممثلكم عبد المهدي الكربلائي، بعدم تشبث المسؤولين بمواقعهم الامر الذي فسره عامة الشيعة وأعداء العملية السياسية باننا المقصودين بهذا الكلام؛ لذا اطالبكم كرئيس وزراء منتخب لدورتين وزعيم الكتلة الاكبر وصاحب اعلى الاصوات في الدورة الثالثة بتوضيح موقفكم والكف عن التدخل في العملية السياسية واختيار شخص رئيس الوزراء، والاقتصار على الارشاد الديني والمعنوي لمقلديكم وترك المجال السياسي لاهله، لان العراق يمر بمرحلة حرجة من تاريخه السياسي والامني ولا يمكنني في ظل هذه الظروف التنازل عن واجبي الوطني في حماية وحدة العراق وشعبه والدفاع عن حقوق من انتخبني وصوت لي".