השאלה המרכזית הנשאלת ע"י רבים עם הגיעה של הפרשה המכונה "פרשת הצוללות" לשלב כתבי האישום היא, איך יתכן שרק ראש הממשלה בנימין נתניהו נחלץ ממנה כמעט ללא פגע? איך יכול להיות שסוללת האנשים הקרובים ביותר לראש הממשלה, עורך דינו ובן דודו, ראש הלשכה שלו, ראש המטה לביטחון לאומי המיועד שלו, מפקד חיל הים לשעבר ומקורבים נוספים לראש הממשלה, כולם טובלים עד צוואר בביצת השחיתות שנחשפה, בעוד רק נתניהו, ראש הפירמידה, מצליח לחמוק מהסיפור מבלי שאפילו נחקר באזהרה?
שמה של הפרשה לקוח מעסקה שאותה ניסה נתניהו לקדם לרכישת שלוש צוללות תקיפה אסטרטגיות מהתאגיד הגרמני "תיסנקרופ", אבל הפרשה גדולה בהרבה מהעסקה הזו. היא מכילה עסקאות רכש ימי ביטחוני נוספות ומאמץ של כנופיית אנשי עסקים, עורכי דין וקצינים לשעבר להשתלט על הרכש הביטחוני הישראלי, להכתיב אותו ולגבות עמלות בהיקפים עצומים.