فضای درگیری مذهبی در منطقه، بازار فتاوی جهادی را از سوی مؤسسات روحانی گرم کرده است. پیش از این فتاوی متعددی از روحانیان سنی در تایید عزیمت به سوریا برای جهاد با رژیم بشار اسد ارائه شده بود. این بار و در واکنش به تشدید درگیری مذهبی در سوریه، فتوایی از یکی از روحانیان قم منتشر شد که در آن به طور ضمنی، رفتن به سوریه برای جهاد با گروه‌های سلفی تایید و مشروع شمرده شده است. این فتوا به صورت پاسخ به پرسشی از آیة الله سید کاظم حائری در صفحه رسمی فیسبوک وی منتشر شده است. پرسش‌کننده درباره جواز رفتن به سوریه برای دفاع از مرقد حضرت زینب دختر امام سوم شیعیان بدون اجازه والدین سؤال می‌کند. وی در پاسخ، این عمل را جایز شمرده و گرفتن اجازه والدین در این امور را لازم نمی‌شمرد. پیش از این آیة الله سید محمد صادق روحانی از روحانیان به نام قم نیز جهاد در سوریه برای حمایت از اماکن مقدس شیعی را مشروع شمرده و کشته‌شدگان در این عمل را شهید شمرده بود. این فتاوی به راه‌اندازی پایگاه‌هایی برای ثبت‌نام رسمی در ایران جهت عزیمت به سوریه برای جهاد انجامیده است.
انتشار این فتوا، موج گسترده‌ای از مخالفت و نارضایتی را در بین مقامات عالی رتبه روحانی حوزه قم و نجف پدید آورده و آن را دیدگاهی نامشروع و غیر قابل قبول شمردند. روزنامه «الشرق الاوسط» از دیدگاه آیة الله سیستانی مبنی بر حرمت رفتن به سوریا برای جهاد خبر داد و از مراجع چهارگانه نجف نقل کرد: «کسانی که برای جهاد به سوریه می‌روند، از دستورات دینی مرجعیت نافرمانی می‌کنند.» سید جواد خوئی از اساتید حوزه نجف، درستی خبر مذکور را در مصاحبه‌ای با المونیتور تایید کرد و افزود که حوزه نجف همواره از دخالت دادن امور دینی در درگیری‌های سیاسی پرهیز کرده و هیچ یک از روحانیان به نام نجف با درگیر شدن شیعیان در جنگ مذهبی در سوریه موافق نیستند.
