הטלת הסגר על רמאללה ביום שני (1 בפברואר), והסרתו באופן חלקי יממה לאחר מכן, מלמדים יותר מכל על המחלוקת בין הפיקוד הבכיר של צה"ל לדרג המדיני בישראל. מאז החלה אינתיפאדת היחידים באוקטובר בשנה שעברה, מופעל על צה"ל לחץ רב להטיל הגבלות תנועה על יישובים פלסטיניים בגדה, בניסיון למנוע מתושביהם להגיע לישראל כדי לבצע פיגועי טרור. בעקבות פיגוע הירי שביצע איש הביטחון הפלסטיני, אמג'ד סכרי, ביום ראשון (31 בינואר) במחסום סמוך לבית אל, נאלץ צה"ל, בפעם הראשונה באינתיפאדה הזאת, לכתר את רמאללה.
במשך חודשים הדף הרמטכ"ל רב אלוף גדי איזנקוט את דרישת הדרג המדיני להטיל סגר על השטחים, בטענה כי הנזק מפעולה כזאת עלול להיות גדול הרבה יותר מהתועלת. "זו תהיה טעות מרה להטיל סגרים וכתרים - זה יפעל נגד האינטרס הישראלי", אמר איזנקוט בכנס במכון למחקרי ביטחון לאומי (INSS) בחודש שעבר [18 בינואר]. הוא הוסיף כי יש צורך לשמר תקווה בעיניי האוכלוסיה הפלסטינית, ושזו תצליח להתפרנס.
