ما زال ارتباط حركة حماس بجماعة الإخوان المسلمين في أكثر من بلد عربي مثار جدل داخلها، وبينها وبين الأنظمة العربية، كالسلطة الفلسطينية ومصر وسوريا التي تطالبها بالتخلي عن ارتباطها العضوي بالجماعة الأم، الإخوان المسلمون، والاقتصار على هويتها الفلسطينية، دون التواصل معهم تنظيمياً وسياسياً.
الجديد في الموضوع، الاتهام غير المسبوق الذي وجهه "شرف القضاة" رئيس مجلس علماء الإخوان المسلمين في الأردن، أعلى سلطة دينية وشرعية داخل الجماعة، ويضم العلماء الشرعيين في الجماعة، ويختلف عن مجلس الشورى، يوم 23/2 بوجود تنظيم سري يقود الجماعة مرتبط بحماس.